1. Uuri - Evolutsiooniliste suhete ja ühise põlvnemise mõistmine

1.5 Kuidas lugeda fülogeneetilist puud

Fülogeneetilised puud näitavad evolutsioonilisi seoseid harunemismustrite kaudu, mis kujutavad, kuidas liigid on aja jooksul ühiste esivanemate hargnemisel lahknenud. Iga harunemispunkt ehk sõlm tähistab ühist esivanemat, keda jagavad sellest hargnevad organismid. Liigid, kellel on hiljutisem ühine esivanem, loetakse omavahel lähedasemalt seotud olevaks kui need, kelle ühine esivanem asub puus sügavamal.

Harude pikkus või asend ei näita, et üks organism on teistest arenenum või „paremini evolutsioneerunud”. Selle asemel peegeldavad harud evolutsioonilise lahknemise mustreid ja ühist ajalugu. Kõik elavad liigid harude otstes on evolutsioneerunud sama kaua.

Fülogeneetilisi puid saab kujutada erinevates vormides—horisontaalselt, vertikaalselt või radiaalselt—ilma, et aluseks olevad suhted muutuksid. Harude pööramine või ümberpaigutamine ei muuda puu evolutsioonilist tähendust, kui harunemiskord jääb samaks. Nende puude õige lugemise oskus on oluline evolutsiooniliste suhete tõlgendamiseks ja täpsete fülogeneetiliste mudelite koostamiseks.

Allpool on visuaalsed näited fülogeneetilistest puudest, mis illustreerivad, kuidas evolutsioonilisi seoseid kujutatakse erinevate organismirühmade vahel:

1. Näide 1: Millised liigid on omavahel lähedasemalt seotud?
   (Allikas: https://www.khanacademy.org/science/ap-biology/natural-selection/phylogeny/a/building-an-evolutionary-tree; 
   https://www.istockphoto.com/vector/biological-evolution-animals-scheme-gm500509454-80808691; 
   https://www.khanacademy.org/science/ap-biology/natural-selection/phylogeny/a/phylogenetic-trees) 
   Selles fülogeneetilises puus jagavad liik A ja liik B hiljutisemat ühist esivanemat kui kumbki liik C-ga. See tähendab, et A ja B on omavahel lähedasemalt seotud, isegi kui liik C võib välja näha sarnane või elada sarnases keskkonnas.
   Lähedust määravad ühised esivanemad, mitte välimus ega asukoht lehel.
2. Samad suhted, erinevad puukujud
   

   

   (Allikas: https://www.researchgate.net/figure/The-different-parts-of-a-rooted-phylogenetic-tree-showing-the-root-branches-nodes-and_fig1_43022487;
   https://yulab-smu.top/treedata-book/chapter4.html; https://users.ugent.be/~avierstr/principles/phylogeny.html)   
   Need puud näevad erinevad välja (horisontaalne, vertikaalne või radiaalne), kuid kujutavad samu evolutsioonilisi seoseid. Harude pööramine või paigutuse muutmine ei muuda puu tähendust, kui harunemiskord jääb muutumatuks.
   Puu kuju ei muuda evolutsioonilisi seoseid.
3. Väärarusaam – evolutsioon ei ole redel
   
   (Allikas: https://www.researchgate.net/figure/Tree-format-translations-for-the-ladders-shown-in-Figs-1a-b-along-with-the-associated_fig3_226685940)

See võrdlus toob esile levinud väärarusaama. Evolutsiooni kujutatakse sageli ekslikult redeli