1. Tyrinėjimas. Virusų pagrindai, jų dalys ir tipai
Šiame skyriuje mokiniai įgyja mokslinį pagrindą, reikalingą suprasti, kas yra virusai ir kodėl jie yra unikalūs biologiniai objektai. Jie tyrinėja, kaip virusų struktūra susijusi su funkcija, kaip virusai dauginasi naudodami šeimininkų ląsteles ir kaip virusai gali būti klasifikuojami į skirtingus tipus. Ši tyrinėjimo fazė parengia mokinius kitoms šio skyriaus etapams, kuriuose jie modeliuos virusus naudodami 3D įrankius ir vizualizuos juos papildytoje realybėje (AR), paverčiant nematomą biologiją interaktyviais mokymosi objektais.
1.3 Pagrindinės viruso dalys (struktūra)
Nors virusai labai skiriasi, daugelis jų turi bendrų pagrindinių struktūrinių komponentų:
- Genetinė medžiaga (genomas): viruso „instrukcijų kodas“. Tai gali būti DNR arba RNR. Pavyzdys Gripas – ssRNR (+): https://microbenotes.com/classification-of-virus/
- Kapsidas: apsauginis baltymų apvalkalas, kuris apgaubia ir apsaugo genomą. Kapsidai dažnai turi geometrines formas, kurios padeda užtikrinti stabilumą ir supakavimą. Pavyzdys: adenovirusas – ikosaedrinis kapsidas: https://bio.libretexts.org/Bookshelves/Introductory_and_General_Biology/General_Biology_2e_(OpenStax)/05:_Unit_V-_Biological_Diversity/5.01:_Viruses/5.1.02:_Viral_Evolution_Morphology_and_Classification
- Apvalkalas (kai kuriuose virusuose): iš šeimininko ląstelės membranos paimtas lipidinis išorinis sluoksnis. Pavyzdys: ŽIV – apvalkalas su gp120 iškyšuliais https://en.wikipedia.org/wiki/Viral_envelope
- Iškyšuliai / paviršiaus baltymai (daugelyje virusų): jie padeda virusui atpažinti ir prisijungti prie šeimininko ląstelės. Pavyzdys: SARS-CoV-2 iškyšulio baltymas: https://morgridge.org/community/teaching-learning/virology-immunology/factsheets/virus-structure/
Pagrindinė idėja studentams: Viruso struktūra nėra atsitiktinė – kiekviena dalis atlieka tam tikrą funkciją (apsauga, prisijungimas, patekimas, replikacija).
Siekiant padėti vizualiai ir konceptualiai suprasti viruso struktūrą, mokiniai raginami peržiūrėti trumpą mokomąjį vaizdo įrašą, kuriame paaiškinama pagrindinė virusų biologija. Vaizdo įraše aiškiai pateikiamos pagrindinės viruso dalys, įskaitant genetinę medžiagą, kapsidą, apvalkalą ir paviršiaus baltymus, bei paaiškinama, kaip šios sudedamosios dalys veikia kartu infekcijos metu. Šis išteklius padeda mokiniams susieti rašytinius aprašymus su dinamiškais vaizdiniais paaiškinimais, todėl sudėtingas mikroskopines struktūras lengviau suprasti prieš pereinant prie 3D modeliavimo ir AR veiklos.
Rekomenduojamas vaizdo įrašas: Khan Academy – Viruses
https://www.khanacademy.org/science/biology/biology-of-viruses/virus-biology/v/viruses