1.5 Kaip skaityti filogenetinį medį

Filogenetiniai medžiai rodo evoliucinius ryšius per šakojimosi modelius, kurie atspindi, kaip rūšys laikui bėgant išsiskyrė nuo bendrų protėvių. Kiekvienas šakojimosi taškas, arba mazgas, atspindi bendrą protėvį, kurį turi iš jo išsišakoję organizmai. Rūšys, kurios turi bendrą protėvį, gyvenusį vėliau, laikomos artimesnėmis nei tos, kurių bendras protėvis gyveno anksčiau.

Šakų ilgis ar padėtis nereiškia, kad vienas organizmas yra labiau išsivystęs ar „geriau evoliucionavęs“ nei kitas. Šakos atspindi evoliucinės divergencijos modelius ir bendrą istoriją. Visos gyvos rūšys šakų galuose evoliucionavo vienodą laiką.

Filogenetiniai medžiai gali būti pateikiami įvairiais formatais – horizontaliais, vertikaliais arba radialiais – nekeičiant pagrindinių santykių. Šakų pasukimas ar pertvarkymas nekeičia medžio evoliucinės reikšmės, jei šakojimosi tvarka lieka ta pati. Supratimas, kaip teisingai skaityti šiuos medžius, yra būtinas norint interpretuoti evoliucinius santykius ir kurti tikslius filogenetinius modelius.

Toliau pateikiami filogenetinių medžių pavyzdžiai, iliustruojantys, kaip evoliuciniai santykiai vaizduojami skirtingose organizmų grupėse:

  1. 1 pavyzdys: Kurios rūšys yra artimesnės?
    (Šaltinis: https://www.khanacademy.org/science/ap-biology/natural-selection/phylogeny/a/building-an-evolutionary-tree; 
    https://www.istockphoto.com/vector/biological-evolution-animals-scheme-gm500509454-80808691;
    https://www.khanacademy.org/science/ap-biology/natural-selection/phylogeny/a/phylogenetic-trees) 
    Šiame filogenetiniame medyje rūšys A ir B turi bendrą protėvį, kuris yra naujesnis nei rūšies C protėvis. Tai reiškia, kad A ir B yra artimiau susijusios viena su kita, net jei rūšis C gali atrodyti panaši arba gyventi panašioje aplinkoje.
    Artimumas nustatomas pagal bendrus protėvius, o ne pagal išvaizdą ar padėtį puslapyje.
  2. Tos pačios giminystės, skirtingos medžio formos

    (Šaltinis: https://www.researchgate.net/figure/The-different-parts-of-a-rooted-phylogenetic-tree-showing-the-root-branches-nodes-and_fig1_43022487 ;
    https://yulab-smu.top/treedata-book/chapter4.html; https://users.ugent.be/~avierstr/principles/phylogeny.html )
    Šie medžiai atrodo skirtingai (horizontalūs, vertikalūs arba radialiniai), bet jie atspindi tuos pačius evoliucinius ryšius . Šakų pasukimas arba išdėstymas nekeičia medžio reikšmės, kol šakojimosi tvarka lieka nepakitusi.
    Medžio forma nekeičia evoliucinių ryšių.
  3. Klaidinga nuomonė – evoliucija nėra kopėčios

    (Šaltinis: https://www.researchgate.net/figure/Tree-format-translations-for-the-ladders-shown-in-Figs-1a-b-along-with-the-associated_fig3_226685940)

Šis palyginimas parodo dažną klaidingą supratimą. Evoliucija dažnai neteisingai vaizduojama kaip kopėčios ar linijinis progresas. Iš tiesų evoliucija vyksta šakojantis, kai iš bendrų protėvių vienu metu vystosi kelios linijos.

Visos rūšys, esančios medžio viršūnėse, yra vienodai išsivysčiusios.