2 pav. Biologinis valymas, šaltinis: https://tinyurl.com/pbdykp7a

Biologinis valymas yra tvarus ir biologinis metodas, kuriuo naudojami gyvi mikroorganizmai, daugiausia bakterijos, grybai, dumbliai ir archeos, siekiant suskaidyti, detoksikuoti arba transformuoti aplinkos teršalus į mažiau kenksmingas formas. Nors tradiciškai biologinis valymas siejamas su dirvožemio tarša, jis pasirodė esąs veiksmingas įvairiose aplinkos srityse, įskaitant užterštą vandenį, užterštą orą ir net radioaktyviųjų atliekų saugyklas. Pavyzdžiui, vandens sistemose naftą skaidančios bakterijos ir maistines medžiagas vartojančios dumbliai naudojami naftos išsiliejimams ir eutrofiniams ežerams valyti. Oro valymo srityje biologiniai filtrai naudoja mikrobinius biologinius plėvelius, kad surinktų ir biologiškai suskaidytų lakius organinius junginius (VOC) ir sieros dujas iš pramoninių išmetamųjų dujų. Be to, radioaktyvi biologinė sanavimas yra nauja sritis, kurioje tiriamos ekstremofilinės bakterijos, pvz., Geobacter ir Deinococcus radiodurans, dėl jų gebėjimo imobilizuoti arba transformuoti radioaktyvius elementus. Vis dažnesnis mikrobų konsorciumų ir genetiškai modifikuotų štamų naudojimas dar labiau išplėtė biologinės sanavimo galimybes sudėtingų ir sunkiai pašalinamų teršalų atveju. Pasak Singh ir Strong (2022), omikos technologijų ir bioinformatikos priemonių integravimas žymiai padidino mikrobų intervencijų aplinkos valymo srityje specifiškumą, greitį ir mastelį. Intensyvėjant pasaulinėms taršos problemoms, biologinis valymas siūlo pigią, mažai energijos reikalaujančią ir ekologiškai atkuriančią alternatyvą tradiciniams cheminiams ir mechaniniams valymo metodams.